赵铭给两个同知、六个佥事配备幕僚，使他们成为一个类似六部的职能机构，处理治下的政务。
赵铭自己也开幕，将浙东收服的华夏、王家勤等人，收为幕府书吏，来帮助自己处理政务，形成一个类似秘书处的班子。
现在马士鳌、陈明遇、陈于阶、冯京第、戴之俊、徐孚远、华夏、王家勤、杨文琦、屠献宸、董德钦等人，便是赵铭属下文官班底。
此外还有一个夏完淳在崇明，不过他并非浙江都指挥使司的官员，而是朝廷官员，备加了监军的头衔，算是朝廷派到东海，监视赵铭的人。
在过一段时间，夏完淳就将来到金塘岛，行使职责。
其实赵铭这么做，到不是想做军阀，只是这样做，能使得他紧握大权，不受外界干扰，不被人坑。
在任命说完后，赵铭遂即正色道“现在职责划分后，本帅希望大家都能负责好各自的事务”
众人纷纷表示会尽职尽责，各人脸上都带着兴奋之色。
赵铭微微颔首，“从明日起，各位便各自行使职责，将东海诸地治理好”
现在赵铭控制的地方，主要有三处，崇明、舟山、台湾北部一小块区域，然后便是沿海众多岛屿。
赵铭对陈明遇道“陈先生，这次本帅从浙东带回来不少人马和物资，你要召集书吏，尽快清点统计。原来金塘、舟山、崇明、台北四卫若是编蛮，可再设一卫，发往台湾屯田”
浙江都指挥使司现在其实有五卫，还有一卫，乃是四明卫，只是这一卫，在四明山中，处于敌战区，不好直接管理，所以赵铭给王翊很大独立性。
明军一卫为五千六百户，每户出正兵一人，其余男丁为馀丁，赵铭的意思是，每满五千六百户，就可增设一卫。
这个卫，即是军事单位，也是行政单位，就相当于一个县。
赵铭准备以后得到的人口，达到一百二十户，就增设百户所，达到一千一百二十户就设千户所，达到五千六百户，就设一卫，并都发往台湾，以卫所方式来开发台湾。
台湾岛上有荷兰人，有西班牙人，还有少民，若是普通移民，肯定无法站稳脚跟，卫所既能屯田自足，又是军事组织，有一定战力，可以站稳脚跟，比普通移民更容易生存下去。
赵铭打算，开发完台湾，今后拓殖海外，也可以采用卫所制度。
陈明遇对于这些已有经验，他微笑起身，拱手道“卑职领命，五日后，便会将文册呈于大帅案上。”
赵铭点了点头，陈明遇做事能直接说出期限，还是相当干练的。
接下来，赵铭又吩咐了一些事情，如各百户所设立蒙学，千户所设中学，卫设立卫学，鼓励各卫屯田开荒，倒也思路清晰，事事井井有条。
这让新投靠之人，都露出惊讶的神情，赵大帅不仅善于打仗，也能治理地方，颇有威势。
在处理完行政上的事情后，赵铭开始关注手下军队。
这次他从李成栋、郑成功、张名振处，借调了不少军官，同时也收拢了不少浙东义军，再加上原来的兵马，他已经有了一镇兵。
这些兵马同样需要建立一个军事体系，来进行管理。
不过此时，需要兵备科，先给新来的将士登记造册，赵铭便先将注意力，转移到了水师身上。
金塘岛，烈港，附近的船台上，六艘巨大的荷兰炮船，停在上面。